Vítězem Nova Author Cupu 2006 se stal po strhujícím finiši Tomáš Vokrouhlík (Česká spořitelna MTB), před Jiřím Friedlem a třetím Lukášem Vlachem (oba Merida Biking Team). Počet startujících se již tradičně blížil třem tisícovkám, trať doznala drobné změny hned po startu v Josefově dole, když oproti minulým rokům, kdy se stoupalo přímo cestou k přehradě, pořadatelé z důvodu zlepšení průjezdnosti zvolili jednodušší a hlavně ale širší výjezd po asfaltové silnici.